La Organización Hellsing (Caballeros Protestantes Reales es el nombre formal) es el foco central de la trama de Hellsing. En el universo de Hellsing, la organización es una parte íntegra de la verdadera estructura de poder de Gran Bretaña, que es, en realidad, gobernada por una aristocracia oculta y por la monarquía. A la organización se le asigna la tarea de proteger las costas de país de toda amenaza sobrenatural.
Millennium
Un misterioso grupo de Nazis que se ha estado ocultando en Brasil desde el final de la Segunda Guerra Mundial. Es la organización detrás del elusivo chip FREAK.NOTA: los chips FREAK solo se ven en el anime. En el manga, los chips se implantaban para estudiar a cada vampiro artificial y sus alrededores. Transmitían el estado, comportamiento, intención, y agresión del vampiro. También se usaban para destruir remotamente al vampiro desde la base de Millennium. Los medios para hacer los vampiros en el manga siguen siendo un misterio.
Iscariote
La Organización Iscariote, nombrada así por Judas Iscariote, el apóstol que traicionó a Jesús, es el ala súper secreta de Vaticano encargada de la persecución y exterminación activas de demonios (tales como vampiros) y herejes. Dado que la Organización Hellsing no solo emplea vampiros, sino que también es operada bajo los principios del protestantismo, Iscariote es su rival natural, a pesar de sus objetivos similares. El arma secreta de la institución Iscariote es el Paladin Alexander Anderson que básicamente es el enemigo natural de Alucard.
Los Wild Geese (Gansos Salvajes)
Los Geese son un grupo de mercenarios de alrededor de 80 miembros, al mando del Capitán Pip Bernadotte. Parecen operar internacionalmente. Habiendo realizado su última misión en Uganda, donde Pip perdió su ojo, en 1994. Se desconoce la antigüedad de este grupo ni si Pip o uno de sus ancestros lo fundó. Los miembros son de etnia, edad, y origen mezclados, y reconocen a Pip como su líder. Walter los describe como profesionales, pero, en general, no son más efectivos en combate cuerpo a cuerpo contra vampiros que cualquier otro soldado humano haya demostrado ser hasta ahora.
NOTA: el término "humano" se usa más bien sueltamente en Hellsing, pero parece indicar seres que no tienen el confort-maldición de la vida o juventud eternas. El Capitán, aunque no es un vampiro, es un hombre lobo y, como tal, es eternamente joven. Esto significa que es un no-humano. Los humanos en Hellsing pueden tener cualquier cantidad de poderes sobrehumanos, e igual merecerse ese título, como lo demuestran Anderson y Walter. En el caso de los Wild Goose, ellos no poseen ningún tipo de poderes sobrenaturales.
La Convención de los Doce
Aparte de la Reina, Hellsing también responde a la Convención de los Doce o las Doce Convenciones. Esta organización, llamada también la Conferencia de la Mesa Redonda, es una sociedad secreta de caballeros (miembros del parlamento, líderes militares, y otros prominentes de la nobleza) que manipulan los asuntos de Inglaterra desde las sombras, casi como los Illuminati. También es similar a la antigua Mesa Redonda, que también juraba lealtad al trono. Mientras que los Caballeros de la Mesa Redonda medievales ocupaban asientos alrededor de una mesa literalmente redonda (para simbolizar igualdad), los mordernos caballeros se sientan a una mesa rectangular alargada, cuyos extremos los ocupan Sir Hellsing y Sir Hugh Islands. Puede que esto sea intencional, ya que Integra y Islands se muestran como los más poderosos e influenciantes de la organización, aunque Integra sea la más joven (22). Sin embargo, en el OVA la mesa es oval, haciendo la determinación de rango más difícil.
Se desconoce si Abraham van Helsing, el fundador de la Organización Hellsing, fue incluido entre las filas de los caballeros. El único predecesor conocido de Integra es Arthur Hellsing, su padre, quien parecía actuar como el anterior "líder" de la organización. Es posible que Richard Hellsing buscara la posición de Integra como directora de Hellsing para poder convertirse en miembro de la Mesa Redonda, más que para liderar la organización.
Sir Shelby M. Penwood es otro miembro. En el anime está a cargo de los medios, y, en el manga, de la seguridad naval.
